时空组学
Stereo-seq是国内生命科学龙头机构华大自主研发的时空转录组技术，该技术基于DNA纳米球（DNA Nano Ball, DNB）开发，是具有高通量、超高分辨率、大视场的原位全景式技术，可以实现同一样本在组织、细胞、亚细胞、分子“四尺度”同时进行空间转录组分析。该技术通过时空芯片捕获组织中的mRNA,并通过空间条形码（Coordinate ID, CID）还原回空间位置，实现组织原位测序，为深入地了解细胞的基因表达及形态与局部环境之间的关系建立强大的研究基础。
纳米级分辨率
实现亚细胞级分子定位
实现亚细胞级分子定位
Stereo-seq 技术的检测分辨率可达到
500nm，实现对单个细胞及分子信息进行空间定位和检测。
500nm，实现对单个细胞及分子信息进行空间定位和检测。
厘米级全景视场
定制芯片满足不同组织需求
定制芯片满足不同组织需求
Stereo-seq 标准Stereo-seq 芯片大小为
1cm×1cm，同时可依据组织大小定制不同尺寸的芯片。
1cm×1cm，同时可依据组织大小定制不同尺寸的芯片。
产品方案
分析内容
Stereo-seq 标准分析
时空转录组的基础分析主要围绕单个样本展开，核心是解析组织切片的空间基因表达模式，同时结合细胞类群特征、发育轨迹、互作关系及功能特征进行系统性分析。
Stereo-seq 高级分析
基于华大 Stereo-seq 技术开展深度数据分析，核心是在基础数据质控基础上，通过多样本整合、精准注释、组间差异、深度功能分析及精细化互作探究，挖掘空间转录组的生物学意义。 同时，在时空转录组高级分析中，单细胞转录组数据的辅助作用可可贯穿细胞注释、差异分析、功能挖掘、细胞互作等核心环节，通过单细胞数据的高分辨率细胞分型优势，为时空数据的"空间定位+细胞功能"做精准赋能。
Stereo-seq FFPE 微生物-宿主互作分析
基于 Stereo-seq V2(FFPE)技术的随机引物策略，可以实现宿主转录组与微生物宏基因组的原位同步检测。所以针对 FFPE 样本我们可以提供微生物-宿主互作专属分析。通过将微生物Reads与宿主基因表达数据在统一空间坐标系内进行整合及细胞类型步采用 Mahalanobis距离椭圆扩展算法精准界定"微生物·宿主互作微区"，在此基础上开展微区特异性差异表达分析与功富集研究系统解析微生物与宿主互作的空间功能特征。
服务流程
产品应用
案例分析
单细胞和时空转录组分析揭示银屑病潜在致病机制
研究背景
研究策略
研究结果
银屑病是一种免疫介导的慢性炎症性皮肤病，其发病机制尚未完全明确，目前已知 IL-23/IL-17 轴在炎症持续中发挥关键作用，但基质细胞（成纤维细胞、血管内皮细胞、血管平滑肌细胞）在疾病进程中的具体作用仍有待深入探究。真皮乳头层是银屑病炎症的核心活跃区域，具有毛细血管数量增多、长度增加及免疫细胞浸润等典型病理特征，血管生成异常被证实是银屑病发病的重要环节。已有研究表明基质细胞具备促血管生成特性，可能参与炎症微环境的调控，但这类细胞的亚型异质性、在银屑病中的功能变化及细胞间相互作用机制尚未清晰阐明，缺乏针对性的研究支撑其作为治疗靶点的潜力，因此亟需通过精准的技术手段解析基质细胞在银屑病中的作用及机制。
细胞鉴定→亚型筛选→功能验证→机制解析
在银屑病皮损的真皮乳头层，WNT5A+成纤维细胞、ITIH5+血管内皮细胞（VECs）和VCAN+血管平滑肌细胞（VSMCs）显著富集。WNT5A+成纤维细胞由WIF1+成纤维细胞转化而来，通过非经典Wnt信号通路异常激活，并与ITIH5+ VECs和VCAN+ VSMCs相互作用，共同驱动异常血管生成和炎症微环境，为靶向基质细胞治疗银屑病提供了新依据。
