Stereo-seq是国内生命科学龙头机构华大自主研发的时空转录组技术,该技术基于DNA纳米球(DNA Nano Ball, DNB)开发,是具有高通量、超高分辨率、大视场的原位全景式技术,可以实现同一样本在组织、细胞、亚细胞、分子“四尺度”同时进行空间转录组分析。该技术通过时空芯片捕获组织中的mRNA,并通过空间条形码(Coordinate ID, CID)还原回空间位置,实现组织原位测序,为深入地了解细胞的基因表达及形态与局部环境之间的关系建立强大的研究基础。
Stereo-seq 标准Stereo-seq 芯片大小为
1 cm × 1 cm,同时可依据组织大小定制不同尺寸的芯片。
目前已有芯片尺寸为0.5 cm × 0.5 cm、1 cm × 1 cm、1 cm × 2 cm、2 cm × 2 cm、2 cm × 3 cm的试剂盒产品
Stereo-seq 技术的检测分辨率可达到
500 nm,实现对单个细胞及分子信息进行空间定位和检测。
*小鼠脑冠状切片。通过基于空间基因表达谱的聚类分析可清晰识别小鼠大脑不同解剖结构。能实现对特定区域的单个细胞及分子信息进行空间定位和检测。
用“细胞身份解码+空间坐标锚定”双视角揭示植物生命的时空动态。
空间转录组技术可精准定位特定区域的基因表达,揭示细胞类型的空间分布及群体间的相互作用,构建组织基因表达图谱。
空间转录组技术为家禽与畜牧领域提供了全新研究视角与工具支撑,在多维度赋能产业发展。
Stereo-seq 作为华大自主研发的超高分辨率时空转录组技术,为免疫微环境研究提供了全新维度。
Stereo-seq在肿瘤研究中可以揭示肿瘤内异质性,探究肿瘤-基质细胞相互作用以及识别空间调控的生物标志物,为肿瘤异质性的探索提供新的研究维度。
单细胞和时空转录组分析揭示银屑病潜在致病机制
需提供 Qubit®、NanoDrop、PFGE、Agilent 2100 中一种或多种形式的样品分析结果。大片段 DNA 建库样品需要基于 Qubit®定量方法,不推荐 NanoDrop 定量。