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产品简介

为解决作物在杂交育种中的早期材料选育效率低，以及现有基因组预测模型泛化能力低的问题，智数生物在海南省种业实验室揭榜挂帅项目的支持下，基于农业大数据，开发了智能育种决策辅助系统（BGI智能育种系统）。在系统使用方面，智数生物已将该系统部署在崖州湾科技城先进计算中心上，育种家可通过访问网站（http://59.50.39.12:8090/），创建育种项目，上传相关基因型-表型数据，在网页上实现表型预测、育种材料筛选。BGI智能育种系统由4个分析平台，1个种质资源数据库组成。

其中，以全基因组选择平台为核心，对目标表型进行预测；以育种表型数据管理平台、基因型数据分析平台为辅助，对育种材料进行统计分析、群体遗传结构分析等工作；以杂交模拟平台为特色，对杂交群体的亲本组配方式进行优选；以种质资源数据库为基础，对系统内置的基因组预测模型进行前期训练工作。

全基因组选择平台内置了10个经典模型，以及1个基因组预测AI模型，并将该模型命名为DeepGxE。同时，该模型也是本平台的第一个创新点。该模型建立基于环境型和基因型数据，且使用GPU加速计算过程。在多个作物上对该模型进行基准测试，结果表明，与经典的基因组预测模型比较，该模型运行速度更快、预测性能更高、泛化性能更高。此外，该模型可用于两类环境型数据：一类是简易的数据，取时间、地点作为环境型数据，适用于多年多点；另一类是详细的气候数据、地理位置数据，如每天的温度、湿度等。本平台的第二个创新点是集成了现有经典的基因组预测模型，可供育种家灵活选择，自主训练。

产品服务

智数生物结合南繁育种基地的技术优势、材料优势、测试点优势，利用自主建设的一流测序平台，以及优秀的生物信息技术团队、人工智能团队，建立结合“AI预测+育种经验”的智能育种决策辅助系统，为育种家提供优质的智能育种服务。我们愿与相关育种企业合作，开展大数据智能育种的合作，充分发挥BGI智能育种系统的优势，建立育种账号，开展全基因组选择育种的合作，并可提供育种材料的测序服务、基因分型服务（如液相芯片捕获试剂盒开发、多重PCR试剂盒开发、少量位点的基因分型等）、个性化生物信息分析（如全基因组关联分析、转录组分析等），高通量基因编辑服务，力争在3到5年内共同打造优质新品种，完成产业转化，实现收益共享。