基于Stereo-seq V2(FFPE)技术的随机引物策略,可以实现宿主转录组与微生物宏基因组的原位同步检测。所以针对 FFPE 样本我们可以提供微生物 - 宿主互作专属分析。通过将微生物 Reads 与宿主基因表达数据在统一空间坐标系内进行整合及 SingleR 细胞类型注释,进一步采用 Mahalanobis 距离椭圆扩展算法精准界定“微生物-宿主互作微区”,在此基础上开展微区特异性差异表达分析与功能富集研究,系统解析微生物与宿主互作的空间功能特征。
需提供 Qubit®、NanoDrop、PFGE、Agilent 2100 中一种或多种形式的样品分析结果。大片段 DNA 建库样品需要基于 Qubit®定量方法,不推荐 NanoDrop 定量。